Den kollektive trafik fungere godt i Berlin. Den består af 331,5 km S-Bahn som fragter ca. 400 millioner passagerer om året. Der er 144,2 km U-Bahn, som bestyres af S-Bahn Berlin GmbH, og fragter ca. 450 mio. passagerer om året. De er 187,7 km straßenbahn, som fragter ca. 170 mio. passagerer om året., 1.626 km bus ruter der fragter ca. 400 mio. passagerer om året, samt et antal flodfærger, som alle bestyret af Berlins Trafikadministration BVG.

S-Bahn er for størstepartens vedkommende et overjordisk jernbanenet, mens U-Bahn er byens undergrundsjernbanesystem. Dog kører de nord-sydlige S-Bahn som undergrundsbane og store deler af den sydlige U1 kører som overjordisk bane.

Sporvognenene (Straßenbahn) er næsten udelukkende i brug i den østlige del af byen, det tidligere Østberlin. Busser betjener passagerer overalt i byen, men tjener hovedsageligt som forbindelse mellem den indre del af byen og de ydre forstæder. Næsten al kollektiv trafik har samme billetsystem.

Der også type af tog, der bruges indenfor Berlin-Brandenburgs trafikområde, RE-Bahn eller "Regionalbahn". Disse tog standser kun på de største stationer i det centrale Berlin, men hvor S-Bahn ikke findes standser regionaltogen med lidt tættere afstande.

Indenfor Berlin kører RE-Bahn flere steder parallellt med S-Bahn, men benytter andre spor.